Pitkittäistutkimuksen tilastolliset menetelmät - Syksy 2005

Kurssilla nyt:

• Toinen kurssikoe maanantaina 12.12. klo 12-14. Koealue: soveltuvin osin kirjan luvut 7-10 (ks. seuraava rivi!) sekä luentorungot 5-9.
• Koealue kirjassa: luku 7; luvut 8.1, 8.2, luvusta 8.3. esimerkki. 8.1., luku 8.4 (mukaanlukien esimerkki 8.5.); luku 9 (soveltuvin osin, teknisimpiä asioita vältellen); luvut 10.1, 10.2 ja 10.3 (alkupuoli).
• J.Jokisen vierailuluennot
• Vastauksia harjoitukseen 7
• Vastauksia harjoitukseen 6 seizure
• Kurssin harjoitustyön (Vaihtoehto 1) ohjeet Harjoitustyön 1 aineisto
• Korjauksia (päivitetty 17.10.2005) Tässä listassa korjauksia luentomuistiinpanoissa havattuihin virheisiin. Se päivittyy kunkin luennon jälkeen. Korjaukset on tehty myös kotisivulta löytyvien muistiinpanojen viimeisimpiin versioihin.
• Kurssin luennot aina ma 12-14 ja ti 14-16, sali B120 (Kumpulan kampus).
• Kurssi kattaa periodit I ja II, viikolla 24.-28.10. ei ole luentoja.
• Ma 21.11 ja Ti 22.11.: ei luentoja.
• Kurssikokeet ti 18.10. (klo 14-16) ja ma 12.12. (klo 12-14).

Laajuus: 8 op (harjoitystyön tekemällä 12op). Vanhojen vaatimusten mukaan laajuus on 4 ov (harjoitustyön tekemällä 6ov)

Asema opetuksessa: Biometrian lääketieteellisen tilastotieteen erikoistumislinjan kurssi.

Kurssikuvaus: Pitkittäistutkimuksessa samoista yksilöistä tehdään mittauksia useassa eri aikapisteessä. Tämä mahdollistaa yksilössä ajan (tai iän) mukana tapahtuvien muutosten erottamisen yksilöiden välisistä eroista. Kurssilla tutustutaan pitkittäistutkimuksen tilastollisiin malleihin ja sovelluksiin. Kurssillakäsiteltäviä asioita ovat mm. satunnaistekijämallit/hierarkkiset mallit, marginaalimallit, latentit prosessimallit sekä puuttuvan tiedon käsittely. Kurssi keskittyy terveys- ja biotieteiden alan sovelluksiin.

Kurssin taustamateriaalia:

• Kurssi noudattelee soveltuvin osin kirjaa Diggle, Heagerty, Liang, Zeger: The Analysis of Longitudinal Data, Oxford University Press 2002, 2nd edition. Saman kirjan aiempi painos käy myös. Lunetorunkojen yhteydessä kerrotaan, mitä kirjan lukua/sivuja materiaali vastaa.
• Luentorungot: ilmestyvät tälle sivulle kurssin myötä (ks. "Kurssilla nyt" yllä sekä jo ilmestyneet lopussa olevasta listasta).

Suositeltavia esitietoja: Tilastotieteen perusopinnot. Matriisilaskennan perusteet.

Luennot syksyllä 2005

Luennoija: FT Kari Auranen

Luentoajat:

• ma 12-14, sali B120
• ti 14-16, sali B120

Kurssin ensimmäinen luento on maanantaina 5.9. klo 12-14 salissa B120. Luentoja ei ole periodien väliviikolla 24.-28.10. eikä 21.-22.11. Viimeinen luento on maanantaina 12.12., jolloin on toinen kurssikoe (ensimmäinen on ti 18.10).

Sisältö: Kurssin alustava sisältö:

1. Pitkittäistutkimuksen piirteitä

2. Pitkittäisaineiston kartoitus

3. Pitkittäisaineistojen yleinen lineaarinen malli

4. Kovarianssirakenteen parametrisia malleja

5. Pitkittäisaineistojen yleistetyt lineaariset mallit

6. Marginaalimallit

7. Satunnaistekijämallit

8. Transitiomallit

9. Puuttuvista havainnoista

Luennot: Seuraavassa luentomuistiinpanoja asiakokonaisuuksina

• 1. Pitkittäistutkimuksen ominaispiirteitä (Diggle et al., 1. luku)
• 2. Pitkittäisaineiston kartoitus (Diggle et al., 3. luku)
• 3. Kovarianssirakenteen robusti estimointi (Diggle et al., 4. luku)
• 4a. Kovarianssirakenteen parametrisia malleja (Diggle et al., 5. luku)
• 4b. Kovarianssirakenteen parametrisia malleja jatkuu (Diggle et al., 5. luku)
• 4c. Yksilöllisten muuttujien estimointi (Diggle et al., 5. luku)
• 5. Pitkittäisaineistojen yleistetyt lineaariset mallit (johdantoa) (Diggle et al., 7. luku)
• 6. Marginaalimalleista (Diggle et al., 8. luku)
• 6b. Marginaalimalleista jatkoa (Diggle et al., 8. luku)
• 7. Satunnaistekijämallit (Diggle et al., 9. luku)
• 7b. Satunnaistekijämallien jatkoa
• 8. Transitiomalleista (Diggle et al., 10. luku)
• 9. Puuttuvista havainnoista (Diggle et al., 13. luku)

Laskuharjoitukset

Kurssiin kuuluu viikottaisia laskuharjoituksia. Harjoituksia käsitellään tiistain luentojen yhteydessä. Harjoitusten ahkerasta tekemisestä saa lisäpisteitä. Ensimmäiset Harjoitustehtävät ilmestyvät tänne harjoitusta edeltävällä viikolla. Ensimmäiset harjoitukset tiistaina 13.9.

• Harjoitus 1 cd4.dat Ohje tehtävään 4/1 cows.dat Ohje tehtävään 5/1 Vastauksia harjoitukseen 1
• Harjoitus 2 bindata1.dat Vastauksia harjoitukseen 2 ohjelma lorelogram
• Harjoitus 3 pigdata pigdatbroad pigsW blockd sikaohje Vastauksia harjoitukseen 3
• Harjoitus 4 cowdata Ohjeita tehtävään 4/4 Vastauksia harjoitukseen 4
• Harjoitus 5 Vastauksia harjoitukseen 5
• Harjoitus 6 crossdata.dat Vihjeitä tehtävään 2/6 seizures.dat Ohje tehtävään 3/6 Vastauksia harjoitukseen 6 seizure
• Harjoitus 7 countdata.txt Vastauksia harjoitukseen 7

Kurssin suoritus

Kurssi (8 op) suoritetaan kurssikokeilla: ti 18.10. (I periodin loppu) ja ma 12.12. Harjoitustyön tekemällä voi suorittaa 12 op:n kokonaisuuden.

Viimeksi päivitetty 2.9.2005
#http://www.rni.helsinki.fi/~kja/lda05/